明军几乎完全丧失了战斗力，全军已无可用药品。军医官说出征前所带药品均有李时珍验过，裕王大怒，下令拘捕李时珍，而军中早已不见李时珍的身影，裕王高拱断定李时珍是景王和严世蕃派来的内奸。山中采药的李时珍通过当地百姓寻得医治痢疾的偏方，治好了监视他的阿木，在回城的途中，李时珍和阿木惊奇地发现，丰连城早已被鞑靼人围得水泄不通。二人冒死穿过敌人的封锁线，回到明军大营，将治痢疾的偏方告诉了将士们。可当他们走进主帅大帐时，高拱立即下令逮捕李时珍。阿木坚持李时珍是忠臣以死相保，并要高拱放了李时珍，自己出城去搬援兵。高拱将信将疑同意阿木出城，但李时珍不能放。
明军将士用过李时珍寻来的偏方后，疫情得到控制。鞑靼人猛烈攻城，裕王与将士同仇敌忾，浴血奋战。阿木搬来援兵，明军大败鞑靼人。裕王和高拱终于认识到李时珍才是堂堂正正的君子。