徐妙云得知真相后直指朱允炆犯了大错，成为了众矢之的。王钺来报，朱棣即将渡江入京，朱允炆惊慌不已。
齐泰向朱允炆建议封锁江面，就地歼灭朱棣，朱允炆认为不妥，还是决定让朱棣单骑过江与他一同祭拜孝陵。
黄子澄建议朱允炆削藩，朱允炆表示同意。三人对话传到了徐妙云耳朵里，徐妙云连忙出宫，希望能够劝阻朱棣进京，但是朱棣执意前往孝陵祭拜，途中遭遇齐泰安排的御林军埋伏，徐增寿等人请求朱允炆以大局为重，放过朱棣。
朱棣面见朱允炆，质问他为何在金川门设伏，方孝孺因朱棣见了朱允炆不跪拜，要将其定罪，朱允炆心软，批准朱棣先去孝陵祭拜。御林军抓了前去送信的徐妙云，并按齐泰的指示将其押入了天牢。
朱允炆留朱棣在皇宫多住几日，并希望朱棣担任左丞相监国，辅佐他治理朝政，朱允炆召徐妙云前来希望能给朱棣一个惊喜，却得知徐妙云并不在东宫，朱允炆焦急万分，遂派人分头寻找。朱棣被朱允炆安排住进了西园，齐泰等人派了大批御林军严加看守。